A missão de cinco anos
Kirk comanda a USS Enterprise numa missão de cinco anos para explorar novos mundos. Spock, o primeiro oficial meio vulcano, dá a lógica; McCoy, o médico, dá o coração; Kirk decide. A tripulação ainda tem Scotty na engenharia, Uhura nas comunicações, Sulu no leme e, depois, Chekov.
Ao longo da série ele enfrenta Klingons e Romulanos, luta com um Gorn numa arena, encontra seu duplo cruel num universo-espelho e revive Khan Noonien Singh, um tirano criado por engenharia genética, que acaba exilado com seus seguidores no planeta Ceti Alpha V. Em "The City on the Edge of Forever", vai parar na Nova York dos anos 1930, se apaixona por Edith Keeler e precisa deixá-la morrer para salvar a história.



















